Cursus universitaire
Juillet 2006 : Agrégation de mathématiques, option probabilités et
statistiques
20 Septembre 2005 : th�se de l'Université Joseph Fourier - Grenoble
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Spécialité : Mathématiques Appliquées
Titre
: Analyse statistique des données issues des biopuces � ADN
Résumé :
Cette th�se est consacr�e � l'analyse
statistique des données issues des biopuces � ADN. Nous nous intéressons ici �
trois problématiques liées aux données du transcript�me.
Dans un premier chapitre, nous étudions le probl�me de la normalisation des
données dont l'objectif est d'éliminer les variations parasites entre les
échantillons des populations pour ne conserver que les variations expliquées par
les phénom�nes biologiques. Nous présentons plusieurs méthodes existantes pour
lesquelles nous proposons des améliorations. Pour guider le choix d'une méthode
de normalisation, une méthode de simulation de données de biopuces est mise au
point.
Dans un deuxi�me chapitre, nous abordons le probl�me de la détection de g�nes
différentiellement exprimés entre deux séries d'expériences. On se ram�ne ici
� un probl�me de test d'hypoth�ses multiples. Plusieurs approches sont
envisagées : sélection de mod�les et pénalisation, méthode FDR basée sur une
décomposition en ondelettes des statistiques de test ou encore seuillage
bayésien.
Dans le dernier chapitre, nous considérons les probl�mes de classification
supervisée pour les données de biopuces. Pour remédier au probl�me du fléau
de la dimension , nous avons développé une méthode semi-paramétrique de
réduction de dimension, basée sur la maximisation d'un crit�re de vraisemblance
locale dans les modéles linéaires généralisés en indice simple. L'étape de
réduction de dimension est alors suivie d'une étape de régression par
polyn�mes locaux pour effectuer la classification supervisée des individus
considérés.
Mots clés
: biopuces, test d'hypoth�ses multiples, sélection de variables, mod�les
linéaires généralisés, régression semi-paramétrique.
Jury :
Serge Dégerine, président
Florence d'Alché-Buc, rapporteur
Ir�ne Gijbels, rapporteur
Badih Ghattas, examinateur
Sophie Lambert-Lacroix, examinatrice
Anestis Antoniadis, directeur de th�se
Marie Dutreix, co-directrice de th�se.
Juin 2001 : DEA de mathématiques appliquées, Mention Bien, Université
Joseph Fourier - Grenoble 1
Juin 2001 : dipl�me d'ingénieur de
l'ENSIMAG, Mention Bien,
INPG - Grenoble 4
